В отделение сердечно-сосудистой хирургии на 20 коек: 10 кардиохирургических, 10 сосудистых – проводятся все виды основных операций на открытом сердце при приобретенных, врожденных пороках, ишемической болезни сердца; а также на артериальной и венозных системах организма. Также выполняются операции при нарушениях ритма сердца, хронической сердечной недостаточности – имплантации электрокардиостимулятора (ЭКС), имплантации кардиовертер -дефибриллятора (ИКД), имплантации ресинхронизирующих устройств (CRT-D), электрофизиологические исследования с радиочастотной аблацией, криоаблации при нарушениях ритма сердца. В год проводится около 150 операций на открытом сердце, около 200 аритмологических операций, более 280 операций на сосудистой системе. В отделении работают 10 врачей, среднего медицинского персонала 8, младшего медицинского персонала 6 человек. Первым заведующим отделения был врач-кардиохирург Альдешев А.А. (приглашенный специалист из г.Алматы, АО «ННЦХ» им.А.Н.Сызганова). В данное время отделение возглавляет Даутбаев Б.Р.